Page 39 - journal-8-1-Full
P. 39
Journal of Thai Traditional & Alternative Medicine Vol. 8 No. 1 January-April 2010 ÛÒ
ª√–¡“≥ Ò ¡‘≈≈‘°√—¡ „ àÀ≈Õ¥∑¥≈Õß¢π“¥ Ò.ı ¡‘≈≈‘≈‘μ√. Õ“√å‚¥¬„™â‰æ√凡Õ√å™π‘¥ Inter Simple Sequence Repeat
®“°π—Èπ∑”°“√ °—¥¥’‡ÕÁπ‡Õ¥â«¬«‘∏’ CTAB μ“¡«‘∏’¥—¥·ª≈ß (ISSR) Òˆ ‰æ√‡¡Õ√剥ⷰà (CT) G, (AG) T, (CT) A,
6
6
6
ÒÚ
®“°«‘∏’¢Õß Doyle and Doyle ¥—ߢ—ÈπμÕπμàÕ‰ªπ’È (GA) TC, (AC) CG, (CT) AG, (GT) C, (GA) G, (AC) G,
8 8 8 8 8 8
‡μ‘¡ “√≈–≈“¬∫—ø‡øÕ√å 2X CTAB extraction ˜ (AG) C, (GA) GT, (AC) CG, (GA) GT, (AC) GA,
8 8 8 8 8
‰¡‚§√≈‘μ√ ≈߉ª„πÀ≈Õ¥¡’ºß‡ âπ„¬∑’Ë∫¥≈–‡Õ’¬¥, π”À≈Õ¥ (GC) CG, ·≈– (GT) CG. Õߧåª√–°Õ∫¢Õß “√‡§¡’„πªØ‘°‘√‘¬“
8 8
‰ª‡¢¬à“‡æ◊ËÕ„Àâ “√≈–≈“¬º ¡°—π¥â«¬‡§√◊ËÕß vortex mixer, ¡’¥—ßπ’È: “√≈–≈“¬∫—ø‡øÕ√å 10X PCR, Mg2Cl Ò.˘ mM,
∫à¡À≈Õ¥∑¥≈Õß„πÕà“ßπÈ”§«∫§ÿ¡Õÿ≥À¿Ÿ¡‘ ˆı Õß»“‡´≈‡´’¬ dNTPs Ò mM, ISSR primer Ò pmole, Taq DNA poly-
π“π Ò ™—Ë«‚¡ß, ‡μ‘¡ øïπÕ≈ : §≈Õ‚√øÕ√å¡ : ‰Õ‚´·Õ¡‘≈ merase Ò ¬Ÿπ‘μ, DNA template ÒÚ π“‚π°√—¡. ‡μ‘¡πÈ”
·Õ≈°ÕŒÕ≈å (Úı:ÚÙ:Ò) ˜‰¡‚§√≈‘μ√, ‡¢¬à“„Àâ “√≈–≈“¬ ‰√⇙◊ÈÕ¥’‰Õ‚Õ‰π´å „Àâ¡’ª√‘¡“μ√√«¡ Ò ‰¡‚§√≈‘μ√, À¬¥
‡ªìπ‡π◊ÈÕ‡¥’¬« 𔉪ªíòπ‡À«’ˬß∑’˧«“¡‡√Á« ÒÙ, √Õ∫μàÕπ“∑’ πÈ”¡—π·√à≈ß„πÀ≈ե撴’´“√å Ò À¬¥. π”À≈Õ¥‰ª„ à„π‡§√◊ËÕß
„™â‡«≈“ ı π“∑’, ¥Ÿ¥‡°Á∫ “√≈–≈“¬™—Èπ∫π ˆ ‰¡‚§√≈‘μ√„ à ‡æ‘Ë¡ª√‘¡“≥ “√æ—π∏ÿ°√√¡ (MJ Research √ÿàπ PCT-200
À≈Õ¥„À¡à, ‡μ‘¡§≈Õ‚√øÕ√å¡ : ‰Õ‚´·Õ¡‘≈ ·Õ≈°ÕŒÕ≈å (ÚÙ:Ò) Peltier Thermal Cycler) ‚¥¬μ—Èß‚ª√·°√¡°“√∑”ß“π¥—ßπ’È :
ˆ ‰¡‚§√≈‘μ√, ‡¢¬à“¥â«¬ vortex mixer 𔉪ªíòπ ÒÙ, Pre-denaturation ∑’Ë ˘ı Õß»“‡´≈‡´’¬ „™â‡«≈“ ı π“∑’ ®”π«π
√Õ∫μàÕπ“∑’ π“π ı π“∑’, ¥Ÿ¥‡°Á∫ “√≈–≈“¬™—Èπ∫π ı Ò √Õ∫, Denaturation ∑’Ë ˘Ù Õß»“‡´≈‡´’¬ „™â‡«≈“ Ùı «‘π“∑’,
‰¡‚§√≈‘μ√„ àÀ≈Õ¥„À¡à. ∑”°“√ °—¥´È”Õ’° Ò √Õ∫ ¥Ÿ¥‡°Á∫ Annealing ∑’Ë™à«ßÕÿ≥À¿Ÿ¡‘ ÙÛ - ˆı Õß»“‡´≈‡´’¬ „™â‡«≈“
“√≈–≈“¬™—Èπ∫π Û ‰¡‚§√≈‘μ√ „ àÀ≈Õ¥„À¡à, ‡μ‘¡ Ò π“∑’, Extension ∑’Ë ˜Ú Õß»“‡´≈‡´’¬ „™â‡«≈“ Ú π“∑’
‡Õ∑“πÕ≈≈â«π ˆ ‰¡‚§√≈‘μ√ ·≈– ·Õ¡‚¡‡π’¬¡ ·Õ´’‡∑μ ·≈– Post-extension ∑’Ë ˜Ú Õß»“‡´≈‡´’¬ „™â‡«≈“ Ò π“∑’.
˜.ı ‚¡≈“√å ˘ ‰¡‚§√≈‘μ√. 𔉪∫à¡∑’Ë -Ú Õß»“‡´≈‡´’¬ „π¢—ÈπμÕπ Annealing ‰æ√‡¡Õ√å·μà≈–™π‘¥®–∂Ÿ°∑¥ Õ∫∑’Ë
π“π Ò ™—Ë«‚¡ß ·≈â«π”À≈Õ¥¡“ªíòπ∑’Ë ÒÙ, √Õ∫μàÕπ“∑’ π“π Õÿ≥À¿Ÿ¡‘μË”°«à“°“√À≈Õ¡≈–≈“¬ (Melting temperature; Tm)
ı π“∑’, ‡∑ à«π¢Õ߇À≈«∑‘Èß, ªíòπ≈â“ßμ–°Õπ¥’‡ÕÁπ‡Õ¥â«¬ ª√–¡“≥ Û-ı Õß»“‡´≈‡´’¬ À≈—ß®“°∑”ªØ‘°‘√‘¬“æ’´’
‡Õ∑“πÕ≈√âÕ¬≈– ˜ ª√‘¡“μ√ Ò ¡‘≈≈‘≈‘μ√ ∑’˧«“¡‡√Á« ÒÙ, Õ“√åμ“¡‚ª√·°√¡∑’Ëμ—È߉«â§√∫·≈â«. π” “√≈–≈“¬¥’‡ÕÁπ‡Õ∑’Ë∂Ÿ°
√Õ∫μàÕπ“∑’ π“π Û π“∑’ ®”π«π Û §√—Èß. º÷Ëßμ–°Õπ¥’‡ÕÁπ‡Õ ‡æ‘Ë¡ª√‘¡“≥¡“·¬°·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ„π·ºàπ«ÿâπÕ–°“‚√ §«“¡‡¢â¡
„Àâ·Àâß ·≈â«≈–≈“¬¥â«¬ “√≈–≈“¬∫—ø‡øÕ√å ∑’Õ’ æ’‡ÕÁ™ ¯. ¢âπ√âÕ¬≈– Ò.ı „π “√≈–≈“¬∫—æ‡øÕ√å 0.5x TBE „™â°√–· ‰ø
‡μ‘¡‡Õπ´—¬¡å RNase Ú ‰¡‚§√≈‘μ√. π”À≈Õ¥‰ª∫à¡∑’Ë Û˜ Ò ‚«≈μå „™â‡«≈“ ˘ π“∑’. ®“°π—Èπ¬âÕ¡·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ¥â«¬
Õß»“‡´≈‡´’¬ π“π Ò ™—Ë«‚¡ß. π” “√≈–≈“¬¥’‡ÕÁπ‡Õ∑’ˉ¥â¡“ “√≈–≈“¬‡Õ∑‘‡¥’¬¡‚∫√‰¡¥å. ∫—π∑÷°¿“æ·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ„μâ√—ß ’
μ√«® Õ∫§ÿ≥¿“æ‚¥¬„™â “√≈–≈“¬¥’‡ÕÁπ‡Õ Û ‰¡‚§√≈‘μ√ ‡Àπ◊Õ¡à«ß.
º ¡°—∫ ’¬âÕ¡ loading π”¡“À¬Õ¥≈ß„π™àÕߢÕß·ºàπ‡®≈ Ò.Ú °“√»÷°…“™π‘¥‰æ√‡¡Õ√å∑’Ë· ¥ß·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ
§«“¡‡¢â¡¢âπ√âÕ¬≈– .¯ „π “√≈–≈“¬∫—æ‡øÕ√å∑’∫’Õ’, „™â ‡Õ°≈—°…≥å
°√–· ‰øøÑ“ ı‚«≈μå, „™â‡«≈“ Ùı π“∑’. ¬âÕ¡·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ π” ¿“«–Õÿ≥À¿Ÿ¡‘∑’ˇÀ¡“– ¡∑’ˉ¥â®“°°“√∑¥≈Õß„π
¥â«¬ “√≈–≈“¬‡Õ∑‘‡¥’¬¡‚∫√‰¡¥å àÕߥŸ·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ„μâ· ß ¢âÕ∑’Ë Ò ¡“∑”ªÆ‘°‘√‘¬“æ’´’Õ“√åÕ’°§√—Èß ‚¥¬„™âÕߧåª√–°Õ∫¢Õß
‡Àπ◊Õ¡à«ß ·≈–∫—π∑÷°¿“æ·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ. π” “√≈–≈“¬¥’‡ÕÁπ‡Õ “√‡§¡’ ·≈– ¿“«–°“√∑”ªØ‘°‘√‘¬“·≈–°“√·¬°·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ
∑’ˉ¥â‰ª»÷°…“„π¢—ÈπμÕπ¥—ßμàÕ‰ªπ’È ¥â«¬«‘∏’Õ‘‡≈Á°‚μ√‚ø√’´‘ ‡À¡◊Õπ∑’Ë°≈à“«‰«â„π¢—ÈπμÕπ¢âÕ∑’Ë Ò.Ò.
Ò. °“√»÷°…“¿“«–∑’ˇÀ¡“– ¡μàÕ°“√‡æ‘Ë¡ª√‘¡“≥ “√ Ú. °“√«‘‡§√“–Àå¢âÕ¡Ÿ≈®“°·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ∑’ˉ¥â®“°°“√‡æ‘Ë¡
æ—π∏ÿ°√√¡¥â«¬ªØ‘°‘√‘¬“æ’´’Õ“√å ª√‘¡“≥¥’‡ÕÁπ‡Õ
Ò.Ò °“√»÷°…“‡æ◊ËÕÀ“Õÿ≥À¿Ÿ¡‘∑’ˇÀ¡“– ¡ π”√Ÿª·∫∫¢Õß·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ∑’ˉ¥â®“°°“√„™â‰æ√‡¡Õ√å∑—Èß
π” “√≈–≈“¬¥’‡ÕÁπ‡Õ¡“‡®◊Õ®“ß„Àâ¡’§«“¡‡¢â¡¢âπ Ù Òˆ ‰æ√‡¡Õ√å ¡“‡ª√’¬∫‡∑’¬∫§«“¡‡À¡◊Õπ·≈–§«“¡·μ°μà“ß
π“‚π°√—¡/‰¡‚§√≈‘μ√. π”¡“‡æ‘Ë¡ª√‘¡“≥¥’‡ÕÁπ‡Õ¥â«¬«‘∏’æ’´’ ¢Õß√Ÿª·∫∫¢Õß·∂∫¥’‡ÕÁπ‡Õ∑’ˇ°‘¥¢÷Èπ ‚¥¬ “¬æ—π∏ÿå∑’˪√“°Ø